Награжден орденами Красной Звезды, «За службу Родине в Вооруженных Силах СССР» III ст., и  многими медалями.

29 октября 2021 г. на Федеральном военном мемориале состоялась церемония захоронения генерал-майора Казакова Юрия Юрьевича.